La COEECI cuenta con un Consejo Directivo (C.D.), conformado por ocho instituciones (ENIEXs) miembros, que la administra, la dirige y que tiene las facultades necesarias para su administración dentro de su objeto social con excepción de los asuntos que la ley o el estatuto atribuyen a la Asamblea General de Asociados. Actualmente, el Consejo Directivo, correspondiente al período 2008-2009, está conformado como sigue:

Presidencia
Juan Martin Beaumont Frañowsky
OXFAM GB

Vice-Presidencia
Jeannette Weller
WELTHUNGERHILFE (Agro Acción Alemana)

Secretaría
Eduardo Contreras
LUTHERAN WORLD RELIEF

Tesorería
María Esther Zevallos León
ASOCIACIÓN SOLIDARIDAD PAISES EMERGENTES - ASPEM

Vocal
Elvira Raffo
IBIS

Vocal
Freya Rondelez
11.11.11.

Vocal
Julio Gamero
CONSEJERÍA DE PROYECTOS

Vocal
Walter Blake
CATHOLIC RELIEF SERVICES - CRS

Representación legal
Esta recae sobre la Presidencia del Consejo Directivo la que está encargada de formalizar y ejecutar los acuerdos de la Asamblea General de Asociados (plenarias y/o extraordinarias) y los del Consejo Directivo de la COEECI.

Domicilio Legal
El domicilio de la COEECI es la ciudad de Lima, su ámbito de acción es todo el territorio nacional y podrá establecer oficinas, filiales y dependencias en cualquier otro lugar de la República del Perú